A FBM não é uma ferramenta de aplicação única. Consoante o comprimento de onda, a potência, a frequência e o modo de administração, pode ser aplicada a uma vasta gama de fins clínicos. As aplicações com maior suporte de evidência relevantes para terapeutas que trabalham com acupuntura, terapia manual ou medicina integrativa incluem: Dor musculoesquelética — em particular tendinopatias, lombalgia, dor cervical e condições articulares. Esta é a área mais investigada e aquela em que a evidência é mais sólida. Regeneração dos tecidos — cicatrização de feridas, redução de cicatrizes e recuperação pós-cirúrgica. A capacidade da luz vermelha e infravermelha próxima de acelerar a reparação celular é um dos mecanismos mais estabelecidos da FBM. Modulação da inflamação — a FBM não suprime simplesmente a inflamação, mas modula-a, o que apoia os processos de resolução do próprio corpo em vez de os bloquear farmacologicamente. Modulação neurológica e da dor — aplicada às vias nervosas e a pontos de acupuntura, a estimulação laser pode influenciar a sinalização da dor através de mecanismos periféricos e centrais. Estimulação de pontos de acupuntura — para profissionais formados em acupuntura tradicional, o laser oferece uma alternativa precisa e não invasiva às agulhas. Isto é particularmente valioso para doentes sensíveis a agulhas, crianças e casos que exigem estimulação sustentada dos pontos.